| نسخه | 4.5 |
|---|---|
| ناشر | Bioinformatics Solutions |
| تاریخ انتشار | ۱۰ مه ۲۰۱۰ |
| تاریخ اضافه شده | ۱۶ ژوئیه ۲۰۱۰ |
| الزامات سیستم عامل | Windows XP/Vista/7 |
| الزامات | None |
| کل بارگیری ها | ۹٬۴۶۴ |
| بارگیری در هفته | ۹ |
| قیمت | Free |
شرح
RAPTOR یک نرم افزار ابتکاری است که برای پیش بینی دقیق ساختار پروتئین طراحی شده است. این ابزار ترکیبی از ابزارهای تجزیه و تحلیل پیشرفته را در یک راه حل نرم افزاری یکپارچه ترکیب کرده و سه روش مختلف نخ گذاری را ارائه می دهد. رویکرد بهینه سازی برنامه نویسی عدد صحیح RAPTOR برای یافتن الگوهای ساختاری اهداف با همسانی توالی پایین بسیار موثر است و قادر به تولید مدل های با کیفیت بالا است. رابط کاربری آسان و مقادیر E قابل فهم آسان برای مبتدیان و متخصصان ایده آل است. بیش از همه ، نمایش بصری خروجی کاربران را قادر می سازد تا نتایج را با یک نگاه سریع درک کنند. با توجه به توالی پروتئین هدف ، اگر پروتئینی همولوگ با ساختار سه بعدی شناخته شده وجود داشته باشد ، می توان با استفاده از ابزار جستجوی توالی مانند PSI-BLAST ، همچنین در RAPTOR ، آن را یافت. سپس ساختار هدف از ساختار شناخته شده ساخته می شود. با این حال ، هنگامی که همسانی توالی قابل توجه نیست ، یعنی کمتر از 25٪ ، PSI-BLAST نمی تواند با اطمینان مطمئنی برخورد کند. برخلاف PSI-BLAST ، که به سادگی یک جستجوی دنباله ای را انجام می دهد ، نخ پروتئین ، شناسایی برابر ، هم از اطلاعات همسانی و هم ساختار استفاده می کند. این توالی پروتئین را با یک ساختار ناشناخته در برابر یک پایگاه داده از ساختارهای شناخته شده اسکن می کند. با استفاده از یک تابع امتیازدهی و انجام تجزیه و تحلیل سازگاری بین ساختارهای سه بعدی و توالی های پروتئینی خطی ، بهترین الگوی ساختاری شناسایی می شود که ساختار توالی از آن ساخته می شود. به عنوان یک نتیجه ، رشته پروتئینی پیش بینی برتر از مدل همسانی در صورت وجود همسانی توالی حاشیه ای دارد.
